MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 40374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021738	TTCACT	2	12	365899	365910	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525656017
6002	NC_021738	CA	3	6	365936	365941	50 %	0 %	0 %	50 %	525656017
6003	NC_021738	ATA	2	6	365968	365973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656017
6004	NC_021738	TGC	2	6	365981	365986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656017
6005	NC_021738	CCA	2	6	366062	366067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656017
6006	NC_021738	ATA	2	6	366169	366174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656017
6007	NC_021738	ATT	2	6	366228	366233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656017
6008	NC_021738	CCT	2	6	366287	366292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525656018
6009	NC_021738	AAT	2	6	366309	366314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656018
6010	NC_021738	CAA	2	6	366324	366329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656018
6011	NC_021738	GGTTGG	2	12	366436	366447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656018
6012	NC_021738	CTTG	2	8	366497	366504	0 %	50 %	25 %	25 %	525656018
6013	NC_021738	GCG	2	6	366510	366515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656018
6014	NC_021738	ATT	2	6	366634	366639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656018
6015	NC_021738	T	6	6	366657	366662	0 %	100 %	0 %	0 %	525656018
6016	NC_021738	TGT	2	6	366737	366742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656018
6017	NC_021738	AT	3	6	366831	366836	50 %	50 %	0 %	0 %	525656018
6018	NC_021738	TCA	2	6	366890	366895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656018
6019	NC_021738	TAT	2	6	367032	367037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656018
6020	NC_021738	C	6	6	367121	367126	0 %	0 %	0 %	100 %	525656019
6021	NC_021738	GCC	2	6	367172	367177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525656019
6022	NC_021738	A	6	6	367191	367196	100 %	0 %	0 %	0 %	525656019
6023	NC_021738	CAC	2	6	367266	367271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656019
6024	NC_021738	TTC	2	6	367308	367313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656019
6025	NC_021738	TCA	2	6	367438	367443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656020
6026	NC_021738	TTTC	2	8	367495	367502	0 %	75 %	0 %	25 %	525656020
6027	NC_021738	ACCTCT	2	12	367635	367646	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525656020
6028	NC_021738	ATAA	2	8	367764	367771	75 %	25 %	0 %	0 %	525656020
6029	NC_021738	TAC	2	6	367850	367855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656020
6030	NC_021738	TGT	2	6	367882	367887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656020
6031	NC_021738	GTG	2	6	367912	367917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656020
6032	NC_021738	AAT	2	6	368008	368013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656020
6033	NC_021738	ATA	2	6	368020	368025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656020
6034	NC_021738	CAC	2	6	368041	368046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656020
6035	NC_021738	TTAA	2	8	368166	368173	50 %	50 %	0 %	0 %	525656021
6036	NC_021738	AGT	2	6	368220	368225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656021
6037	NC_021738	CAG	2	6	368226	368231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656021
6038	NC_021738	AG	3	6	368435	368440	50 %	0 %	50 %	0 %	525656022
6039	NC_021738	TTC	2	6	368475	368480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656022
6040	NC_021738	GGT	2	6	368578	368583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656022
6041	NC_021738	TCA	2	6	368608	368613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656022
6042	NC_021738	ATTG	2	8	368630	368637	25 %	50 %	25 %	0 %	525656022
6043	NC_021738	CAGG	2	8	368658	368665	25 %	0 %	50 %	25 %	525656022
6044	NC_021738	CGTG	2	8	368791	368798	0 %	25 %	50 %	25 %	525656022
6045	NC_021738	CTG	2	6	368833	368838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656022
6046	NC_021738	AGT	2	6	368911	368916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656022
6047	NC_021738	CTT	2	6	368938	368943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656022
6048	NC_021738	AAC	2	6	369000	369005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656022
6049	NC_021738	T	6	6	369017	369022	0 %	100 %	0 %	0 %	525656022
6050	NC_021738	GTT	2	6	369066	369071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656022
6051	NC_021738	TTG	2	6	369119	369124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656022
6052	NC_021738	CAA	2	6	369151	369156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656022
6053	NC_021738	TAA	2	6	369199	369204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656022
6054	NC_021738	AAAG	2	8	369219	369226	75 %	0 %	25 %	0 %	525656022
6055	NC_021738	AGT	2	6	369233	369238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656022
6056	NC_021738	ATC	2	6	369545	369550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655630
6057	NC_021738	TCAA	2	8	369551	369558	50 %	25 %	0 %	25 %	525655630
6058	NC_021738	CAC	2	6	369630	369635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655630
6059	NC_021738	ATA	2	6	369638	369643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655630
6060	NC_021738	T	6	6	369674	369679	0 %	100 %	0 %	0 %	525655630
6061	NC_021738	TAT	2	6	369867	369872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656023
6062	NC_021738	T	6	6	369914	369919	0 %	100 %	0 %	0 %	525656023
6063	NC_021738	CAA	2	6	370093	370098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656023
6064	NC_021738	TTA	2	6	370138	370143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656023
6065	NC_021738	ATTGC	2	10	370148	370157	20 %	40 %	20 %	20 %	525656023
6066	NC_021738	GTT	2	6	370171	370176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656023
6067	NC_021738	AAC	2	6	370282	370287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656023
6068	NC_021738	ACC	2	6	370299	370304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656023
6069	NC_021738	GAAGAT	2	12	370323	370334	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525656023
6070	NC_021738	AAT	2	6	370346	370351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656023
6071	NC_021738	GTT	2	6	370360	370365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656023
6072	NC_021738	AAC	2	6	370389	370394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656023
6073	NC_021738	TCTTTT	2	12	370398	370409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525656023
6074	NC_021738	TCA	2	6	370467	370472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656023
6075	NC_021738	TAT	2	6	370486	370491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656023
6076	NC_021738	T	6	6	370523	370528	0 %	100 %	0 %	0 %	525656023
6077	NC_021738	ATA	2	6	370539	370544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656023
6078	NC_021738	ATT	2	6	370562	370567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656023
6079	NC_021738	CTT	2	6	370610	370615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656024
6080	NC_021738	GTT	2	6	370717	370722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656024
6081	NC_021738	CTG	2	6	370736	370741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656024
6082	NC_021738	CTT	2	6	370769	370774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656024
6083	NC_021738	TAT	2	6	370826	370831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656024
6084	NC_021738	TAT	2	6	370928	370933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656024
6085	NC_021738	CA	3	6	370945	370950	50 %	0 %	0 %	50 %	525656024
6086	NC_021738	AGA	3	9	371016	371024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656024
6087	NC_021738	TGA	2	6	371117	371122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656024
6088	NC_021738	ATT	2	6	371133	371138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656024
6089	NC_021738	ACA	2	6	371159	371164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656024
6090	NC_021738	TCA	2	6	371167	371172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656024
6091	NC_021738	GAA	2	6	371185	371190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656024
6092	NC_021738	A	6	6	371189	371194	100 %	0 %	0 %	0 %	525656024
6093	NC_021738	T	6	6	371356	371361	0 %	100 %	0 %	0 %	525656025
6094	NC_021738	GTT	2	6	371363	371368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656025
6095	NC_021738	CCA	2	6	371451	371456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656025
6096	NC_021738	TAT	2	6	371533	371538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656025
6097	NC_021738	CTAT	2	8	371574	371581	25 %	50 %	0 %	25 %	525656025
6098	NC_021738	AAT	2	6	371637	371642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656025
6099	NC_021738	ACC	2	6	371759	371764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656025
6100	NC_021738	CATCAG	2	12	371809	371820	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525656025
6101	NC_021738	CTG	2	6	371854	371859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656025
6102	NC_021738	CAT	2	6	371872	371877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656025
6103	NC_021738	CCA	2	6	371961	371966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656025
6104	NC_021738	AGC	2	6	371987	371992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656025
6105	NC_021738	TCT	2	6	372006	372011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656025
6106	NC_021738	TTG	2	6	372032	372037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656025
6107	NC_021738	AAC	2	6	372200	372205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656025
6108	NC_021738	CTT	2	6	372250	372255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656025
6109	NC_021738	T	6	6	372293	372298	0 %	100 %	0 %	0 %	525656025
6110	NC_021738	TAT	2	6	372341	372346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656025
6111	NC_021738	CAA	2	6	372373	372378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656025
6112	NC_021738	TAT	2	6	372379	372384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656025
6113	NC_021738	CAA	2	6	372388	372393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656025
6114	NC_021738	TGC	2	6	372434	372439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656025
6115	NC_021738	CAA	2	6	372451	372456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656025
6116	NC_021738	TGA	2	6	372478	372483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656025
6117	NC_021738	GAA	2	6	372508	372513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656025
6118	NC_021738	TA	4	8	372520	372527	50 %	50 %	0 %	0 %	525656025
6119	NC_021738	CTAT	2	8	372561	372568	25 %	50 %	0 %	25 %	525656025
6120	NC_021738	AGC	2	6	372617	372622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656025
6121	NC_021738	TAA	2	6	372656	372661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656025
6122	NC_021738	CTT	2	6	372716	372721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656025
6123	NC_021738	AAT	2	6	372723	372728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656025
6124	NC_021738	ATC	2	6	372773	372778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656025
6125	NC_021738	GCT	3	9	372795	372803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656025
6126	NC_021738	CAA	2	6	372811	372816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656025
6127	NC_021738	AGC	2	6	372854	372859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656025
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6130	NC_021738	ATC	2	6	373020	373025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656025
6131	NC_021738	TGC	2	6	373064	373069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656025
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6133	NC_021738	TCA	2	6	373185	373190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656025
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6135	NC_021738	A	7	7	373324	373330	100 %	0 %	0 %	0 %	525656025
6136	NC_021738	CTG	2	6	373432	373437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656025
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6153	NC_021738	TCTA	2	8	374566	374573	25 %	50 %	0 %	25 %	525656027
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6155	NC_021738	T	6	6	374651	374656	0 %	100 %	0 %	0 %	525656027
6156	NC_021738	TCT	2	6	374672	374677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656027
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6159	NC_021738	AAT	2	6	374730	374735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656027
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6161	NC_021738	CAAA	2	8	374848	374855	75 %	0 %	0 %	25 %	525656027
6162	NC_021738	CTT	2	6	374859	374864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656027
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6227	NC_021738	GATTTA	2	12	378857	378868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525656033
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6229	NC_021738	CGG	2	6	378948	378953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656033
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6231	NC_021738	A	7	7	379060	379066	100 %	0 %	0 %	0 %	525656033
6232	NC_021738	T	6	6	379126	379131	0 %	100 %	0 %	0 %	525656033
6233	NC_021738	CCG	2	6	379229	379234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525656033
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6235	NC_021738	CAT	3	9	379272	379280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656033
6236	NC_021738	CAA	2	6	379293	379298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656033
6237	NC_021738	ACC	2	6	379310	379315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656033
6238	NC_021738	GCT	2	6	379358	379363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656033
6239	NC_021738	CA	3	6	379378	379383	50 %	0 %	0 %	50 %	525656033
6240	NC_021738	CCG	2	6	379426	379431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655631
6241	NC_021738	ACC	2	6	379440	379445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655631
6242	NC_021738	TGC	2	6	379507	379512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655631
6243	NC_021738	CGG	2	6	379527	379532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655631
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